Metsandus- ja maaehitusinstituut moodustati Eesti Maaülikooli struktuurireformi käigus metsandusteaduskonna, maainseneriteaduskonna ning metsandusliku uurimisinstituudi baasil. Instituut alustas tegevust 1. jaanuaril 2005.a.

Metsandus- ja maaehitusinstituut vastutab õppetöö läbiviimise eest geodeesia,  loodusvarade kasutamise ja kaitse, kinnisvara planeerimise, maakorralduse, maaehituse, metsamajanduse, metsatööstuse ja veemajanduse erialal. Mitmeid eespool loetletud erialasid on võimalik õppida ainult Eesti Maaülikooli metsandus- ja maaehitusinstituudis, üksikutel aladel toimub õpe ka teistes ülikoolides.

Instituudi liikmeskond teeb heal rahvusvahelisel tasemel õppe- ja teadustööd, osaleb jätkusuutliku metsanduse põhimõtete ning ökoloogiliste tehnoloogiate väljatöötamisel ja rakendamisel metsakasvatuse ja metsaökoloogia, metsakorralduse, metsatööstuse, geomaatika, maaehituse ning veemajanduse vastutusvaldkondades.